巢菜分为大巢菜和小巢菜。前者功效：调中，利大小肠，润大肠；益气清神；活血，止血，生血；缓解咳嗽；还可治疗腰痛、肾虚等。后者功效：治疗流鼻血不止；治疗疔疮；以及治疗热疟的作用。
1、大巢菜的功效
（1）调中作用：这个功效在古籍《本草拾遗》中有过记载。其中明确写到其有调中、利大小肠的作用。在另外一部书《海药本草》中还记载了另一个作用，即“主利水道，润大肠”的作用。
（2）益气清神：它还具有使人觉得神清气爽的功能，以及提升人精神的功能，使人的工作和生活更有效率。这个作用在许多书中同样有明确记载：“益气、清神、强志······”
（3）活血止血等：它还可以应用于伤口的疗治，可以止血。还可促进生血、生肌，有利于外伤伤口的恢复速度。该作用在草木便方中有记录。
（4）缓解咳嗽：对于多种原因引发的咳嗽反应，比如感冒等，它也有缓解的作用。
（5）治疗腰痛、肾虚等：对于一些具体的疾病也作用，比如腰酸腰痛、肾虚等。在四川省的《中药志》中有提到。
2、小巢菜的功效
（1）止住鼻血：有时鼻血流淌无法有效止住。这时可以取适量植物将其研成粉末，煮之后服用，即可尽快止住鼻血。
（2）治疗疔疮：取新鲜的小巢菜全草，加入盐之后捣碎，用来外敷。
（3）治疗热疟：将其捣烂，取它的汁水服用。
